O Fundo de Defesa dos Direitos Fundamentais do Ministério Público do Estado da Bahia (FDDF-MPBA) tem o propósito de custear projetos, ações e atividades voltados à promoção, proteção e defesa dos direitos fundamentais em diversas áreas, incluindo direitos humanos, meio ambiente, saúde, educação, infância e adolescência, patrimônio público e segurança pública. Para cumprir sua missão de forma eficaz e transparente, o FDDF-MPBA possui uma estrutura organizacional bem definida, detalhada no organograma a seguir.